Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
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