Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
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GBX1Q14549 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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GBX1Q14549 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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GBX1Q14549 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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GBX1Q14549 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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GBX1Q14549 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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GBX1Q14549 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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GBX1Q14549 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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GBX1Q14549 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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GBX1Q14549 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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GBX1Q14549 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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GBX1Q14549 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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GBX1Q14549 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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GBX1Q14549 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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