Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4AQ14139 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
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