Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP5Q14008 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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