Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCINQ13939 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCINQ13939 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCINQ13939 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCINQ13939 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCINQ13939 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCINQ13939 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCINQ13939 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCINQ13939 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCINQ13939 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCINQ13939 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCINQ13939 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCINQ13939 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCINQ13939 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCINQ13939 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCINQ13939 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCINQ13939 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCINQ13939 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCINQ13939 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCINQ13939 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCINQ13939 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CCINQ13939 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CCINQ13939 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCINQ13939 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCINQ13939 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCINQ13939 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCINQ13939 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCINQ13939 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCINQ13939 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCINQ13939 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCINQ13939 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCINQ13939 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCINQ13939 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCINQ13939 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCINQ13939 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCINQ13939 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCINQ13939 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCINQ13939 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCINQ13939 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCINQ13939 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCINQ13939 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CCINQ13939 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCINQ13939 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCINQ13939 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCINQ13939 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCINQ13939 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CCINQ13939 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCINQ13939 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCINQ13939 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCINQ13939 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCINQ13939 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCINQ13939 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCINQ13939 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCINQ13939 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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CCINQ13939 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCINQ13939 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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CCINQ13939 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCINQ13939 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCINQ13939 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCINQ13939 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCINQ13939 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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CCINQ13939 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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CCINQ13939 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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CCINQ13939 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCINQ13939 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCINQ13939 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCINQ13939 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCINQ13939 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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CCINQ13939 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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CCINQ13939 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCINQ13939 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCINQ13939 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCINQ13939 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CCINQ13939 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCINQ13939 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCINQ13939 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCINQ13939 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCINQ13939 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCINQ13939 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCINQ13939 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCINQ13939 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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