Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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