Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA7Q13683 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA7Q13683 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms