Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DNASE1L3Q13609 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DNASE1L3Q13609 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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