Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PICALMQ13492 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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