Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
UBE2V1Q13404 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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