Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B2Q13367 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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