Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3BPQ13352 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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