Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3FQ13275 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
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