Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H3Q13133 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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