Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP4Q13115 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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