Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK3Q13003 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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