Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMA1Q12791 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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