Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SREBF2Q12772 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SREBF2Q12772 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
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