Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
HMGXB3Q12766 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
HMGXB3Q12766 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
HMGXB3Q12766 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
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