Protein–RNA interactions for Protein: Q12490

TY1B-BL, Transposon Ty1-BL Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BLQ12490 CTK3YML112W 891 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 YMR099CYMR099C 894 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 BST1YFL025C 3090 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 SHS1YDL225W 1656 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 MUB1YMR100W 1863 nt0.76□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 NBL1YHR199C-A 222 nt0.76□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 YIL161WYIL161W 708 nt0.76□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 YIM2YMR151W 438 nt0.76□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt0.76□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 YBR277CYBR277C 402 nt0.76□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 MNE1YOR350C 1992 nt0.76□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 EST2YLR318W 2655 nt0.76□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 ECM11YDR446W 909 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 ATG10YLL042C 504 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 SLF1YDR515W 1344 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 ARK1YNL020C 1917 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 ATP16YDL004W 483 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 UBC9YDL064W 474 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 YER189WYER189W 369 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 EPT1YHR123W 1176 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 YLR169WYLR169W 354 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 NGL1YOL042W 1092 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 SHU2YDR078C 672 nt0.74□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 YEA4YEL004W 1029 nt0.74□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 HHT2YNL031C 411 nt0.74□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 PAF1YBR279W 1338 nt0.74□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 BET5YML077W 480 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 WHI3YNL197C 1986 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 JJJ2YJL162C 1752 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 UBC5YDR059C 447 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 RRG1YDR065W 1098 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 YGR114CYGR114C 390 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 BEM3YPL115C 3387 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 PES4YFR023W 1836 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 HSE1YHL002W 1359 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 ESA1YOR244W 1338 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 YDR018CYDR018C 1191 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 SRL1YOR247W 633 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-BLQ12490 ALY2YJL084C 3141 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-BLQ12490 YGL138CYGL138C 1038 nt0.71□□□□□ -2.3
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TY1B-BLQ12490 TOA1YOR194C 861 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-BLQ12490 KAP122YGL016W 3246 nt0.71□□□□□ -2.3
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TY1B-BLQ12490 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt0.7□□□□□ -2.3
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TY1B-BLQ12490 YLR402WYLR402W 192 nt0.7□□□□□ -2.3
TY1B-BLQ12490 DIG2YDR480W 972 nt0.7□□□□□ -2.3
TY1B-BLQ12490 UAF30YOR295W 687 nt0.7□□□□□ -2.3
TY1B-BLQ12490 RXT2YBR095C 1293 nt0.7□□□□□ -2.3
TY1B-BLQ12490 CRM1YGR218W 3255 nt0.7□□□□□ -2.3
TY1B-BLQ12490 HMI1YOL095C 2121 nt0.69□□□□□ -2.3
TY1B-BLQ12490 YLR149CYLR149C 2193 nt0.69□□□□□ -2.3
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TY1B-BLQ12490 SRL4YPL033C 846 nt0.69□□□□□ -2.3
TY1B-BLQ12490 CDC50YCR094W 1176 nt0.68□□□□□ -2.3
TY1B-BLQ12490 CIC1YHR052W 1131 nt0.68□□□□□ -2.3
TY1B-BLQ12490 YCR108CYCR108C 192 nt0.68□□□□□ -2.3
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TY1B-BLQ12490 snR191snR191 274 nt0.68□□□□□ -2.3
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TY1B-BLQ12490 UPF3YGR072W 1164 nt0.67□□□□□ -2.3
TY1B-BLQ12490 CET1YPL228W 1650 nt0.67□□□□□ -2.3
TY1B-BLQ12490 DSE1YER124C 1722 nt0.66□□□□□ -2.3
TY1B-BLQ12490 SEC63YOR254C 1992 nt0.66□□□□□ -2.3
TY1B-BLQ12490 CHC1YGL206C 4962 nt0.66□□□□□ -2.3
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TY1B-BLQ12490 YIL089WYIL089W 618 nt0.66□□□□□ -2.3
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TY1B-BLQ12490 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt0.66□□□□□ -2.3
TY1B-BLQ12490 GIM3YNL153C 390 nt0.66□□□□□ -2.3
TY1B-BLQ12490 FIG1YBR040W 897 nt0.66□□□□□ -2.3
TY1B-BLQ12490 ASI3YNL008C 2031 nt0.66□□□□□ -2.3
TY1B-BLQ12490 REX3YLR107W 1215 nt0.65□□□□□ -2.3
TY1B-BLQ12490 AIM6YDL237W 1173 nt0.65□□□□□ -2.31
TY1B-BLQ12490 SRP21YKL122C 504 nt0.65□□□□□ -2.31
TY1B-BLQ12490 YHL012WYHL012W 1482 nt0.64□□□□□ -2.31
TY1B-BLQ12490 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt0.64□□□□□ -2.31
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TY1B-BLQ12490 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.63□□□□□ -2.31
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TY1B-BLQ12490 ASM4YDL088C 1587 nt0.61□□□□□ -2.31
TY1B-BLQ12490 FYV4YHR059W 393 nt0.61□□□□□ -2.31
TY1B-BLQ12490 SRB4YER022W 2064 nt0.61□□□□□ -2.31
TY1B-BLQ12490 snR68snR68 136 nt0.6□□□□□ -2.31
TY1B-BLQ12490 YAP3YHL009C 993 nt0.6□□□□□ -2.31
TY1B-BLQ12490 SPC1YJR010C-A 285 nt0.6□□□□□ -2.31
TY1B-BLQ12490 PET123YOR158W 957 nt0.6□□□□□ -2.31
TY1B-BLQ12490 LST4YKL176C 2487 nt0.6□□□□□ -2.31
TY1B-BLQ12490 YNL034WYNL034W 1839 nt0.6□□□□□ -2.31
TY1B-BLQ12490 NOP53YPL146C 1368 nt0.6□□□□□ -2.31
TY1B-BLQ12490 YGL039WYGL039W 1047 nt0.6□□□□□ -2.31
TY1B-BLQ12490 YNR068CYNR068C 819 nt0.6□□□□□ -2.31
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