Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.47□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 PEP8YJL053W 1140 nt2.47□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt2.47□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 TIF11YMR260C 462 nt2.47□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.47□□□□□ -2.01
LSP1Q12230 snR56snR56 88 nt2.46□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 IRC4YDR540C 540 nt2.46□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 YJR079WYJR079W 330 nt2.46□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 PSY1YKL076C 384 nt2.46□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 YLR101CYLR101C 396 nt2.46□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 YLR269CYLR269C 351 nt2.46□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 RPS1AYLR441C 768 nt2.46□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.46□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 CMC2YBL059C-A 330 nt2.46□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 YOL134CYOL134C 390 nt2.46□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 FYV12YOR183W 390 nt2.46□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 MSS18YPR134W 807 nt2.46□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 YNL034WYNL034W 1839 nt2.46□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 BNI1YNL271C 5862 nt2.46□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 SPP41YDR464W 4308 nt2.46□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 FUS1YCL027W 1539 nt2.46□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 RAV1YJR033C 4074 nt2.46□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 APC2YLR127C 2562 nt2.46□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 ALK2YBL009W 2031 nt2.46□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 GIS1YDR096W 2685 nt2.45□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 AGA2YGL032C 264 nt2.45□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 VPH2YKL119C 648 nt2.45□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 ESF2YNR054C 951 nt2.45□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 snR54snR54 86 nt2.45□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 DPB11YJL090C 2295 nt2.45□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 RGA1YOR127W 3024 nt2.45□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 NPR1YNL183C 2373 nt2.45□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 YDL118WYDL118W 381 nt2.44□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 GPI19YDR437W 423 nt2.44□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 RPS17BYDR447C 411 nt2.44□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 AAD16YFL057C 459 nt2.44□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 LAG1YHL003C 1236 nt2.44□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 YJR023CYJR023C 402 nt2.44□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 YKL063CYKL063C 504 nt2.44□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 CMS1YLR003C 876 nt2.44□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 RMP1YLR145W 606 nt2.44□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 SEN15YMR059W 387 nt2.44□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.44□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 YPL197CYPL197C 414 nt2.44□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 GCV2YMR189W 3105 nt2.44□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 YIL080WYIL080W 4722 nt2.44□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 FKS1YLR342W 5631 nt2.44□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 SPB1YCL054W 2526 nt2.44□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 PPN1YDR452W 2025 nt2.44□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 YDR186CYDR186C 2634 nt2.43□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 STH1YIL126W 4080 nt2.43□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 YDR157WYDR157W 402 nt2.43□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 NOP19YGR251W 591 nt2.43□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.43□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 RPB11YOL005C 363 nt2.43□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 LEE1YPL054W 906 nt2.43□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 SPO23YBR250W 1572 nt2.43□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 YIL166CYIL166C 1629 nt2.42□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 ROY1YMR258C 1662 nt2.42□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 snR70snR70 164 nt2.42□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 ADK1YDR226W 669 nt2.42□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.42□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 YHR125WYHR125W 306 nt2.42□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 TPM2YIL138C 486 nt2.42□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 PET191YJR034W 327 nt2.42□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 COQ10YOL008W 624 nt2.42□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 CDC33YOL139C 642 nt2.42□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 RSA1YPL193W 1146 nt2.42□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 RLF2YPR018W 1821 nt2.42□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 GPI17YDR434W 1605 nt2.42□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 PUF4YGL014W 2667 nt2.42□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.42□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.42□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.42□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 MDM32YOR147W 1869 nt2.41□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 YER006C-AYER006C-A 318 nt2.41□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 YER135CYER135C 393 nt2.41□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 Q0142Q0142 177 nt2.41□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 CRG1YHR209W 876 nt2.41□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 TEN1YLR010C 483 nt2.41□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 RPS7BYNL096C 573 nt2.41□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 FPR1YNL135C 345 nt2.41□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 VTC3YPL019C 2508 nt2.41□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 NOP14YDL148C 2433 nt2.41□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 HSC82YMR186W 2118 nt2.41□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 VPS41YDR080W 2979 nt2.4□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 NUP170YBL079W 4509 nt2.4□□□□□ -2.02
LSP1Q12230 YGL165CYGL165C 579 nt2.4□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 URA10YMR271C 684 nt2.4□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 YOR248WYOR248W 303 nt2.4□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 ATP15YPL271W 189 nt2.4□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 YPR012WYPR012W 255 nt2.4□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 ECM5YMR176W 4236 nt2.4□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 RNH70YGR276C 1662 nt2.4□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 NDD1YOR372C 1665 nt2.4□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 AFI1YOR129C 2682 nt2.4□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 KSP1YHR082C 3090 nt2.4□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 YER079WYER079W 633 nt2.39□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 GLC7YER133W 939 nt2.39□□□□□ -2.03
LSP1Q12230 NBL1YHR199C-A 222 nt2.39□□□□□ -2.03
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