Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

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Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 MNL1YHR204W 2391 nt4.63□□□□□ -1.67
NCR1Q12200 NSP1YJL041W 2472 nt4.63□□□□□ -1.67
NCR1Q12200 NUP82YJL061W 2142 nt4.63□□□□□ -1.67
NCR1Q12200 PRE4YFR050C 801 nt4.62□□□□□ -1.67
NCR1Q12200 CDC31YOR257W 486 nt4.62□□□□□ -1.67
NCR1Q12200 FZO1YBR179C 2568 nt4.62□□□□□ -1.67
NCR1Q12200 ETP1YHL010C 1758 nt4.62□□□□□ -1.67
NCR1Q12200 SSB1YDL229W 1842 nt4.62□□□□□ -1.67
NCR1Q12200 YRM1YOR172W 2361 nt4.62□□□□□ -1.67
NCR1Q12200 YBR174CYBR174C 315 nt4.61□□□□□ -1.67
NCR1Q12200 HSC82YMR186W 2118 nt4.61□□□□□ -1.67
NCR1Q12200 AHC1YOR023C 1701 nt4.6□□□□□ -1.67
NCR1Q12200 GDE1YPL110C 3672 nt4.6□□□□□ -1.67
NCR1Q12200 SEC63YOR254C 1992 nt4.6□□□□□ -1.67
NCR1Q12200 COX5BYIL111W 456 nt4.6□□□□□ -1.67
NCR1Q12200 YCL046WYCL046W 324 nt4.6□□□□□ -1.67
NCR1Q12200 SEA4YBL104C 3117 nt4.6□□□□□ -1.67
NCR1Q12200 FLC1YPL221W 2382 nt4.6□□□□□ -1.67
NCR1Q12200 REG1YDR028C 3045 nt4.59□□□□□ -1.67
NCR1Q12200 YOR019WYOR019W 2193 nt4.59□□□□□ -1.67
NCR1Q12200 snR53snR53 91 nt4.59□□□□□ -1.67
NCR1Q12200 MDV1YJL112W 2145 nt4.58□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 ROG1YGL144C 2058 nt4.58□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 FRE8YLR047C 2061 nt4.58□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 MNN4YKL201C 3537 nt4.58□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 HAL9YOL089C 3093 nt4.58□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt4.58□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt4.58□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 TMN3YER113C 2121 nt4.58□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 YPK1YKL126W 2043 nt4.58□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 CDC15YAR019C 2925 nt4.58□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 YNL144CYNL144C 2223 nt4.57□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 YPL044CYPL044C 549 nt4.57□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 IKS1YJL057C 2004 nt4.56□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 YML116W-AYML116W-A 303 nt4.56□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 CWH41YGL027C 2502 nt4.56□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 HIS4YCL030C 2400 nt4.56□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 NOC3YLR002C 1992 nt4.56□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.55□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.55□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 GRX8YLR364W 330 nt4.55□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 YOR218CYOR218C 420 nt4.55□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 CWC22YGR278W 1734 nt4.55□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 MCM10YIL150C 1716 nt4.55□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 EPO1YMR124W 2832 nt4.54□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 UTP8YGR128C 2142 nt4.54□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 PLC1YPL268W 2610 nt4.54□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 RCO1YMR075W 2055 nt4.54□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt4.54□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 FPR1YNL135C 345 nt4.54□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 OM14YBR230C 405 nt4.54□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 CLN3YAL040C 1743 nt4.54□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 ALR2YFL050C 2577 nt4.54□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 KIC1YHR102W 3243 nt4.53□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 MSK1YNL073W 1731 nt4.53□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 RPS18AYDR450W 441 nt4.53□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt4.53□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.53□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.53□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.53□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.53□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.53□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.53□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.53□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 RPG1YBR079C 2895 nt4.53□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 NAB3YPL190C 2409 nt4.53□□□□□ -1.68
NCR1Q12200 VPS53YJL029C 2469 nt4.52□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 snR7-SsnR7-S 179 nt4.52□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 ALO1YML086C 1581 nt4.52□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 ABP140YOR239W 1887 nt4.52□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 GYL1YMR192W 2163 nt4.51□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 KAR3YPR141C 2190 nt4.51□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 RNR1YER070W 2667 nt4.51□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 YJL181WYJL181W 1836 nt4.51□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 DAP2YHR028C 2457 nt4.51□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 YDR521WYDR521W 336 nt4.51□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt4.51□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 KEX1YGL203C 2190 nt4.5□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 SLY1YDR189W 2001 nt4.5□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.5□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.5□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.5□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.5□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.5□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.5□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.5□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.5□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.5□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.5□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.5□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.5□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.5□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.5□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 YGL024WYGL024W 336 nt4.5□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 PEX1YKL197C 3132 nt4.5□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 FAA1YOR317W 2103 nt4.49□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 NUP2YLR335W 2163 nt4.49□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 PDS5YMR076C 3834 nt4.49□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 HUL4YJR036C 2679 nt4.49□□□□□ -1.69
NCR1Q12200 STV1YMR054W 2673 nt4.49□□□□□ -1.69
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