Protein–RNA interactions for Protein: Q12060

HFI1, Transcriptional coactivator HFI1/ADA1, yeastyeast

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HFI1Q12060 PDR3YBL005W 2931 nt2.96□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 GCD6YDR211W 2139 nt2.96□□□□□ -1.93
HFI1Q12060 RMT2YDR465C 1239 nt2.96□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 UBC7YMR022W 498 nt2.96□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 COX7YMR256C 183 nt2.96□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 MGR1YCL044C 1254 nt2.96□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 DNL4YOR005C 2835 nt2.96□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 TPS2YDR074W 2691 nt2.95□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 YER137W-AYER137W-A 306 nt2.95□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 LCL2YLR104W 396 nt2.95□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 NUP82YJL061W 2142 nt2.95□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 YPL150WYPL150W 2706 nt2.94□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 BCK1YJL095W 4437 nt2.94□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 RPS20YHL015W 366 nt2.94□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 RPL25YOL127W 429 nt2.94□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 SKT5YBL061C 2091 nt2.94□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 FKS3YMR306W 5358 nt2.93□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.93□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.93□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.93□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.93□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.93□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.93□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 NCE101YJL205C 162 nt2.93□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 RAM2YKL019W 951 nt2.93□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 RGM1YMR182C 636 nt2.93□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.93□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 YOR121CYOR121C 306 nt2.93□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 YBR197CYBR197C 654 nt2.93□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 NAB3YPL190C 2409 nt2.93□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 DBP7YKR024C 2229 nt2.93□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 YJL181WYJL181W 1836 nt2.92□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 AAD16YFL057C 459 nt2.92□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 PHD1YKL043W 1101 nt2.92□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt2.92□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 YLR458WYLR458W 381 nt2.92□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 RPL20AYMR242C 519 nt2.92□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 YOR146WYOR146W 306 nt2.92□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 EGD1YPL037C 474 nt2.92□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 DUG2YBR281C 2637 nt2.92□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 COX1Q0045 1605 nt2.92□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 PUF6YDR496C 1971 nt2.92□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 UBP14YBR058C 2346 nt2.92□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 VPS52YDR484W 1926 nt2.91□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 DYN2YDR424C 279 nt2.91□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 YGR035CYGR035C 351 nt2.91□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 URM1YIL008W 300 nt2.91□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.91□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 snR43snR43 209 nt2.91□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 ASG1YIL130W 2895 nt2.9□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 KAP104YBR017C 2757 nt2.9□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 MSS11YMR164C 2277 nt2.9□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 VPS41YDR080W 2979 nt2.9□□□□□ -1.94
HFI1Q12060 MET6YER091C 2304 nt2.9□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 CYR1YJL005W 6081 nt2.9□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 RAX2YLR084C 3663 nt2.9□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 YLR031WYLR031W 561 nt2.9□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 RPS22BYLR367W 393 nt2.9□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 CCW14YLR390W-A 717 nt2.9□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 MSL5YLR116W 1431 nt2.9□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 GCV2YMR189W 3105 nt2.89□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 RPO41YFL036W 4056 nt2.89□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt2.89□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 YBL071CYBL071C 309 nt2.89□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 YBL108WYBL108W 306 nt2.89□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 FRE2YKL220C 2136 nt2.89□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 ATG13YPR185W 2217 nt2.88□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 YDL041WYDL041W 354 nt2.88□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 NEW1YPL226W 3591 nt2.87□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 YEL057CYEL057C 702 nt2.87□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 AYR1YIL124W 894 nt2.87□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 RPL40AYIL148W 387 nt2.87□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 FPR1YNL135C 345 nt2.87□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 RSN1YMR266W 2862 nt2.87□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 IRC10YOL015W 1761 nt2.87□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 FIR1YER032W 2631 nt2.87□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 KSP1YHR082C 3090 nt2.87□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 CAF120YNL278W 3183 nt2.86□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 AYT1YLL063C 1425 nt2.86□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 PTP3YER075C 2787 nt2.86□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 SLN1YIL147C 3663 nt2.86□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 RTT102YGR275W 474 nt2.86□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.86□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 YNL010WYNL010W 726 nt2.86□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 YNL146WYNL146W 303 nt2.86□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 SEC26YDR238C 2922 nt2.86□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 TFC4YGR047C 3078 nt2.86□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 YPR089WYPR089W 2667 nt2.86□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 IKI3YLR384C 4050 nt2.85□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 snR79snR79 84 nt2.85□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 MZM1YDR493W 372 nt2.85□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 RPL40BYKR094C 387 nt2.85□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 YPL238CYPL238C 390 nt2.85□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 YSY6YBR162W-A 198 nt2.85□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 MMS1YPR164W 4224 nt2.84□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 ESC1YMR219W 4977 nt2.84□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 RNP1YLL046C 750 nt2.84□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 ATP3YBR039W 936 nt2.84□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt2.84□□□□□ -1.95
HFI1Q12060 PRP8YHR165C 7242 nt2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.7 ms