Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.14□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 IRC16YPR038W 360 nt2.14□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 PRP6YBR055C 2700 nt2.14□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 SWR1YDR334W 4545 nt2.14□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 NUP100YKL068W 2880 nt2.13□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YDR114CYDR114C 303 nt2.13□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 RPS17BYDR447C 411 nt2.13□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YHR130CYHR130C 336 nt2.13□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt2.13□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 SIP18YMR175W 240 nt2.13□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 IGO1YNL157W 507 nt2.13□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 MES1YGR264C 2256 nt2.13□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YEL043WYEL043W 2871 nt2.13□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 MMS22YLR320W 4365 nt2.13□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 BI4Q0120 1917 nt2.13□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 HNT1YDL125C 477 nt2.12□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YRB1YDR002W 606 nt2.12□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.12□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 HUR1YGL168W 333 nt2.12□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 TWF1YGR080W 999 nt2.12□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt2.12□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.12□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.12□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YHC1YLR298C 696 nt2.12□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt2.12□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YNL046WYNL046W 519 nt2.12□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.12□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 SWM2YNR004W 441 nt2.12□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 LEE1YPL054W 906 nt2.12□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 PHO2YDL106C 1680 nt2.12□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 PSD2YGR170W 3417 nt2.11□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 BAS1YKR099W 2436 nt2.11□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 SPE1YKL184W 1401 nt2.11□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 MRP10YDL045W-A 288 nt2.11□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 TIF35YDR429C 825 nt2.11□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 AGA2YGL032C 264 nt2.11□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 ACB1YGR037C 264 nt2.11□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.11□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 LSM2YBL026W 288 nt2.11□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 CMC2YBL059C-A 330 nt2.11□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 HHT2YNL031C 411 nt2.11□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 RPL25YOL127W 429 nt2.11□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 ATP3YBR039W 936 nt2.11□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YFH1YDL120W 525 nt2.1□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YDR157WYDR157W 402 nt2.1□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 GPI8YDR331W 1236 nt2.1□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.1□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YLR334CYLR334C 381 nt2.1□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.1□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YPL034WYPL034W 498 nt2.1□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.1□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YPL261CYPL261C 309 nt2.1□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YPR012WYPR012W 255 nt2.1□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 DNF1YER166W 4716 nt2.1□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YKR078WYKR078W 1758 nt2.1□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 SSD1YDR293C 3753 nt2.1□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 SPO23YBR250W 1572 nt2.1□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 SSF2YDR312W 1362 nt2.1□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YPR089WYPR089W 2667 nt2.09□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 PEX8YGR077C 1770 nt2.09□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 GIM4YEL003W 336 nt2.09□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 PEX4YGR133W 552 nt2.09□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 HRI1YLR301W 735 nt2.09□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 PKR1YMR123W 369 nt2.09□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 TIF11YMR260C 462 nt2.09□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YMR320WYMR320W 306 nt2.09□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 MLH1YMR167W 2310 nt2.09□□□□□ -2.07
YPQ1Q12010 YER079WYER079W 633 nt2.08□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 RNR4YGR180C 1038 nt2.08□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 CRG1YHR209W 876 nt2.08□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 PET191YJR034W 327 nt2.08□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 UTP30YKR060W 825 nt2.08□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 ARV1YLR242C 966 nt2.08□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YML108WYML108W 318 nt2.08□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 FYV12YOR183W 390 nt2.08□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt2.08□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YBR197CYBR197C 654 nt2.08□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 PSO2YMR137C 1986 nt2.08□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 IRA2YOL081W 9240 nt2.08□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 KOG1YHR186C 4674 nt2.07□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 SAP185YJL098W 3177 nt2.07□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 PAU8YAL068C 363 nt2.07□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YLR101CYLR101C 396 nt2.07□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.07□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 PAU20YOL161C 363 nt2.07□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 ARR2YPR200C 393 nt2.07□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 SNF12YNR023W 1701 nt2.07□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 UFD4YKL010C 4452 nt2.07□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 SPF1YEL031W 3648 nt2.07□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 PRK1YIL095W 2433 nt2.07□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 SEC16YPL085W 6588 nt2.07□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 EDS1YBR033W 2760 nt2.06□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 TIM9YEL020W-A 264 nt2.06□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.06□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 ECL1YGR146C 636 nt2.06□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YLR269CYLR269C 351 nt2.06□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.06□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YOL150CYOL150C 312 nt2.06□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.06□□□□□ -2.08
YPQ1Q12010 KIP1YBL063W 3336 nt2.06□□□□□ -2.08
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