Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDR1Q08345 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDR1Q08345 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms