Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP1-1Q07627 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP1-1Q07627 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms