Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
EXOSC9Q06265 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EXOSC9Q06265 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms