Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN1Q04323 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms