Protein–RNA interactions for Protein: Q03702

CCE1, Cruciform cutting endonuclease 1, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCE1Q03702 RPL37AYLR185W 267 nt2.15□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 RPS22BYLR367W 393 nt2.15□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 URA10YMR271C 684 nt2.15□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 IRC16YPR038W 360 nt2.15□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 YPK1YKL126W 2043 nt2.15□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 TOR2YKL203C 7425 nt2.15□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 YOL098CYOL098C 3114 nt2.14□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 UBP15YMR304W 3693 nt2.14□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 BNA7YDR428C 786 nt2.14□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 COX13YGL191W 390 nt2.14□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 DGK1YOR311C 873 nt2.14□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 YPL197CYPL197C 414 nt2.14□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 FKS1YLR342W 5631 nt2.14□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 INP51YIL002C 2841 nt2.14□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.14□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 ASM4YDL088C 1587 nt2.14□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 KSP1YHR082C 3090 nt2.14□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 BRO1YPL084W 2535 nt2.13□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.13□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 RPS24AYER074W 408 nt2.13□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.13□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 YPS5YGL259W 498 nt2.13□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 ACB1YGR037C 264 nt2.13□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 PEX4YGR133W 552 nt2.13□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.13□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 ATP7YKL016C 525 nt2.13□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 RAM2YKL019W 951 nt2.13□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 YLR458WYLR458W 381 nt2.13□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 PKR1YMR123W 369 nt2.13□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 RPS7BYNL096C 573 nt2.13□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 SSY1YDR160W 2559 nt2.13□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 BRE1YDL074C 2103 nt2.12□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 PES4YFR023W 1836 nt2.12□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 HOS4YIL112W 3252 nt2.12□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 TFC3YAL001C 3483 nt2.12□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.12□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 SPE1YKL184W 1401 nt2.12□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 MRP10YDL045W-A 288 nt2.12□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.12□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 BIG1YHR101C 1008 nt2.12□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 CCW14YLR390W-A 717 nt2.12□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 PEX17YNL214W 600 nt2.12□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 YOR105WYOR105W 327 nt2.12□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.12□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 MGR1YCL044C 1254 nt2.12□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 YJL181WYJL181W 1836 nt2.12□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 CLN3YAL040C 1743 nt2.11□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 RPL40AYIL148W 387 nt2.11□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 YJL007CYJL007C 315 nt2.11□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.11□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 YJR079WYJR079W 330 nt2.11□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 YLR171WYLR171W 390 nt2.11□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 SYM1YLR251W 594 nt2.11□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 DDR48YMR173W 1293 nt2.11□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 ICY1YMR195W 384 nt2.11□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 ALK2YBL009W 2031 nt2.1□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 RVS161YCR009C 798 nt2.1□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 TIM8YJR135W-A 264 nt2.1□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 RMP1YLR145W 606 nt2.1□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 HSC82YMR186W 2118 nt2.1□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 IGO1YNL157W 507 nt2.1□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 UFD4YKL010C 4452 nt2.09□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 VPS16YPL045W 2397 nt2.09□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 GYP5YPL249C 2685 nt2.09□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 ATG11YPR049C 3537 nt2.09□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 SMB1YER029C 591 nt2.09□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 BI2Q0110 1272 nt2.09□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 BRP1YGL007W 378 nt2.09□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 NOP15YNL110C 663 nt2.09□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 SPC29YPL124W 762 nt2.09□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 ATP15YPL271W 189 nt2.09□□□□□ -2.07
CCE1Q03702 YNL018CYNL018C 1839 nt2.09□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.09□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 PRK1YIL095W 2433 nt2.09□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 SNU114YKL173W 3027 nt2.08□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 SAP185YJL098W 3177 nt2.08□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 SDC1YDR469W 528 nt2.08□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 RPI1YIL119C 1224 nt2.08□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.08□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt2.08□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 CBF2YGR140W 2871 nt2.08□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.08□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.08□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.08□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 YFR016CYFR016C 3702 nt2.08□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 YFH1YDL120W 525 nt2.07□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 YRB1YDR002W 606 nt2.07□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 LCL2YLR104W 396 nt2.07□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 YLR379WYLR379W 375 nt2.07□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 YBR277CYBR277C 402 nt2.07□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 SNX41YDR425W 1878 nt2.07□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 UBP11YKR098C 2154 nt2.06□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 YEL043WYEL043W 2871 nt2.06□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 VAR1Q0140 1197 nt2.06□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 YML108WYML108W 318 nt2.06□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 SEN15YMR059W 387 nt2.06□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 SIP18YMR175W 240 nt2.06□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 YMR320WYMR320W 306 nt2.06□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 YPL205CYPL205C 345 nt2.06□□□□□ -2.08
CCE1Q03702 SIR4YDR227W 4077 nt2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.5 ms