Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPCQ03188 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms