Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 AP000842.4-201ENST00000638781 748 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms