Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTN2Q02246 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms