Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MC1RQ01726 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MC1RQ01726 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms