Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms