Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM2Q00987 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms