Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2C1P98194 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms