Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PITX1P78337 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PITX1P78337 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PITX1P78337 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PITX1P78337 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PITX1P78337 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PITX1P78337 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PITX1P78337 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PITX1P78337 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PITX1P78337 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PITX1P78337 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PITX1P78337 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PITX1P78337 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PITX1P78337 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PITX1P78337 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PITX1P78337 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PITX1P78337 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PITX1P78337 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX1P78337 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX1P78337 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX1P78337 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX1P78337 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX1P78337 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX1P78337 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX1P78337 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX1P78337 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX1P78337 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX1P78337 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX1P78337 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX1P78337 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX1P78337 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX1P78337 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX1P78337 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX1P78337 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX1P78337 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX1P78337 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX1P78337 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX1P78337 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX1P78337 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX1P78337 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX1P78337 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX1P78337 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX1P78337 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX1P78337 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX1P78337 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX1P78337 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX1P78337 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX1P78337 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX1P78337 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX1P78337 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX1P78337 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX1P78337 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX1P78337 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX1P78337 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX1P78337 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX1P78337 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX1P78337 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX1P78337 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX1P78337 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX1P78337 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX1P78337 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX1P78337 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX1P78337 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX1P78337 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX1P78337 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX1P78337 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX1P78337 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX1P78337 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX1P78337 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX1P78337 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX1P78337 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX1P78337 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX1P78337 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX1P78337 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX1P78337 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX1P78337 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX1P78337 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX1P78337 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX1P78337 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX1P78337 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX1P78337 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX1P78337 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX1P78337 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX1P78337 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX1P78337 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX1P78337 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX1P78337 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX1P78337 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX1P78337 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX1P78337 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX1P78337 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX1P78337 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX1P78337 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX1P78337 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX1P78337 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX1P78337 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX1P78337 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX1P78337 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX1P78337 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX1P78337 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms