Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTG1P63261 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms