Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHB4P54760 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms