Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms