Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms