Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF2A2P52657 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2A2P52657 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2A2P52657 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms