Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCN3P51790 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCN3P51790 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCN3P51790 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN3P51790 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms