Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC3P51654 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC3P51654 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC3P51654 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC3P51654 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC3P51654 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC3P51654 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC3P51654 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC3P51654 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC3P51654 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC3P51654 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC3P51654 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC3P51654 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC3P51654 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC3P51654 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPC3P51654 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC3P51654 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC3P51654 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC3P51654 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC3P51654 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC3P51654 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC3P51654 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC3P51654 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC3P51654 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC3P51654 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC3P51654 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC3P51654 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC3P51654 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC3P51654 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC3P51654 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC3P51654 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC3P51654 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC3P51654 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC3P51654 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC3P51654 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC3P51654 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC3P51654 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC3P51654 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC3P51654 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC3P51654 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC3P51654 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC3P51654 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC3P51654 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC3P51654 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC3P51654 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC3P51654 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPC3P51654 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPC3P51654 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPC3P51654 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPC3P51654 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPC3P51654 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPC3P51654 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GPC3P51654 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPC3P51654 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPC3P51654 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPC3P51654 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPC3P51654 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPC3P51654 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPC3P51654 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPC3P51654 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC3P51654 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC3P51654 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC3P51654 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC3P51654 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC3P51654 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC3P51654 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC3P51654 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC3P51654 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC3P51654 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC3P51654 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPC3P51654 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC3P51654 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC3P51654 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC3P51654 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC3P51654 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC3P51654 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC3P51654 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC3P51654 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC3P51654 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC3P51654 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC3P51654 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC3P51654 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC3P51654 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC3P51654 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC3P51654 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC3P51654 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC3P51654 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC3P51654 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC3P51654 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPC3P51654 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC3P51654 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC3P51654 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC3P51654 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC3P51654 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC3P51654 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC3P51654 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC3P51654 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC3P51654 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC3P51654 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC3P51654 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms