Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRE11P49959 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRE11P49959 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRE11P49959 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRE11P49959 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRE11P49959 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRE11P49959 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRE11P49959 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRE11P49959 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRE11P49959 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRE11P49959 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRE11P49959 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRE11P49959 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRE11P49959 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRE11P49959 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRE11P49959 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRE11P49959 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRE11P49959 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRE11P49959 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRE11P49959 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRE11P49959 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRE11P49959 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRE11P49959 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRE11P49959 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MRE11P49959 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRE11P49959 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRE11P49959 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRE11P49959 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRE11P49959 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRE11P49959 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRE11P49959 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRE11P49959 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MRE11P49959 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRE11P49959 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRE11P49959 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRE11P49959 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRE11P49959 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRE11P49959 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRE11P49959 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MRE11P49959 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MRE11P49959 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRE11P49959 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRE11P49959 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MRE11P49959 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MRE11P49959 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRE11P49959 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRE11P49959 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRE11P49959 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRE11P49959 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRE11P49959 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRE11P49959 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRE11P49959 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRE11P49959 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRE11P49959 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRE11P49959 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MRE11P49959 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRE11P49959 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRE11P49959 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRE11P49959 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRE11P49959 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRE11P49959 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRE11P49959 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRE11P49959 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRE11P49959 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRE11P49959 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRE11P49959 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRE11P49959 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRE11P49959 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRE11P49959 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRE11P49959 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRE11P49959 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRE11P49959 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRE11P49959 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRE11P49959 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRE11P49959 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRE11P49959 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRE11P49959 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRE11P49959 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRE11P49959 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRE11P49959 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRE11P49959 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRE11P49959 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRE11P49959 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MRE11P49959 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRE11P49959 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRE11P49959 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRE11P49959 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRE11P49959 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRE11P49959 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRE11P49959 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRE11P49959 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRE11P49959 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRE11P49959 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRE11P49959 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRE11P49959 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRE11P49959 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRE11P49959 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRE11P49959 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRE11P49959 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRE11P49959 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms