Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GSK3BP49841 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms