Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSEN1P49768 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSEN1P49768 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms