Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP1P48552 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms