Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL35P42766 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RPL35P42766 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL35P42766 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL35P42766 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms