Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMPOP42166 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMPOP42166 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMPOP42166 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMPOP42166 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMPOP42166 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMPOP42166 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMPOP42166 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMPOP42166 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMPOP42166 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMPOP42166 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMPOP42166 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMPOP42166 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMPOP42166 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMPOP42166 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMPOP42166 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMPOP42166 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMPOP42166 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMPOP42166 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMPOP42166 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMPOP42166 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMPOP42166 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMPOP42166 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMPOP42166 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TMPOP42166 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMPOP42166 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMPOP42166 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMPOP42166 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMPOP42166 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMPOP42166 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMPOP42166 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMPOP42166 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMPOP42166 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMPOP42166 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMPOP42166 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMPOP42166 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMPOP42166 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMPOP42166 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMPOP42166 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMPOP42166 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMPOP42166 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMPOP42166 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMPOP42166 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMPOP42166 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMPOP42166 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMPOP42166 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMPOP42166 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMPOP42166 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMPOP42166 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMPOP42166 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMPOP42166 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMPOP42166 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMPOP42166 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMPOP42166 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMPOP42166 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMPOP42166 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMPOP42166 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMPOP42166 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMPOP42166 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMPOP42166 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMPOP42166 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMPOP42166 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMPOP42166 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMPOP42166 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMPOP42166 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMPOP42166 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMPOP42166 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMPOP42166 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMPOP42166 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMPOP42166 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMPOP42166 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMPOP42166 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMPOP42166 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMPOP42166 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMPOP42166 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMPOP42166 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMPOP42166 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMPOP42166 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMPOP42166 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMPOP42166 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMPOP42166 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMPOP42166 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMPOP42166 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMPOP42166 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMPOP42166 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMPOP42166 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMPOP42166 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMPOP42166 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMPOP42166 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMPOP42166 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMPOP42166 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMPOP42166 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMPOP42166 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMPOP42166 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMPOP42166 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMPOP42166 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMPOP42166 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMPOP42166 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMPOP42166 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMPOP42166 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms